เซลล์ต้นกำเนิดสามารถรวมสัญญาณจากสภาพแวดล้อมและประสานพฤติกรรมของพวกเขาข้ามเนื้อเยื่อผ่านเครือข่ายของหลอดเลือดในบริเวณใกล้เคียงเส้นเลือดฝอยน้ำเหลือง ซึ่งเป็นเส้นเลือดชั้นดีที่ขนส่งเซลล์ภูมิคุ้มกันและระบายของเหลวออกจากเนื้อเยื่อ เป็นตัวแทนของศูนย์กลางการส่งสัญญาณที่สื่อสารกับเซลล์ต้นกำเนิดเพื่อควบคุมการทำงานของพวกมัน
ด้วยคำแนะนำระดับโมเลกุลจากระบบน้ำเหลือง เซลล์ต้นกำเนิดจะผลิตเซลล์ลูกสาวเพื่อเติมเยื่อบุลำไส้หรือสร้างใหม่ด้วยตนเองเพื่อเติมสำรองเซลล์ต้นกำเนิดข้อมูลเชิงลึกใหม่เกี่ยวกับส่วนประกอบหลักของลำไส้ ซึ่งการสื่อสารที่หยุดชะงักอาจส่งผลต่อความผิดปกติของลำไส้ กุญแจสำคัญในการรักษาโรคเหล่านี้คือหาว่าใครคุยกับใครในระบบนิเวศนี้ เซลล์ต้นกำเนิดจากลำไส้อาศัยอยู่ในสิ่งที่เรียกว่า crypts ซึ่งพบที่ฐานของการเยื้องที่หนาแน่นในเยื่อบุลำไส้ เซลล์ต้นกำเนิดอาจต่ออายุและอยู่ในห้องใต้ดิน หรือแยกออกเป็นเซลล์พิเศษ ซึ่งจะย้ายออกจากห้องใต้ดินเพื่อเติมเต็มเยื่อบุลำไส้